觀旅局說明，場館建置分成三大階段，包含主體結構工程、基本營運設施工程、營運展示裝修工程，縣市合併後，前二任市長著手規劃及興建海洋館主體工程，其中第一階段主體結構工程已於108年5月驗收完成。

觀旅局表示，第二階段基本營運設施工程，由建設局及觀旅局分工合作、設計完成後自109年8月5日第一次上網招標，逢國內缺工、缺料、原物料上漲及疫情影響，歷經6次流廢標，在市府多次檢討調整工程標案內容及積極籌措經費的努力下，110年9月20日終於順利開工。

觀旅局指出，目前市府正進行基本營運設施工程，預計今年底完工，後續將再依「促進民間參與公共建設法」辦理點交給OT廠商海珹股份有限公司進行3.8億元的營運展示裝修工程，裝修約需1年工期，預計112年底正式營運；該廠商具有行銷經營屏東海生館的專業知識及經驗，將結合教育、展示、體驗活動、休閒娛樂、社會責任等多元功能，行銷地方觀光及推廣產業資源，帶動海線觀光地區發展。